"Kämpferin im Untergrund" ist inspiriert von der bedeutendsten Undercover-Operation gegen die ETA, einem Einsatz, der zu einem Wendepunkt in Spaniens Kampf gegen den Terrorismus wurde. Der Film spielt in den 1990er- und 2000er-Jahren und erzählt die Geschichte von Amaia (gespielt von Susana Abaitua), einer jungen Polizistin, die mehr als ein Jahrzehnt verdeckt in der Terrororganisation verbringt, um geheime Waffenlager („Zulos“) in Südfrankreich aufzuspüren.