Zusammenfassung
Im Jahr 1957 ist der kalte Krieg in vollem Gange. Professor Henry “Indiana” Jones wird gemeinsam mit seinem Freund Mac von sowjetischen Agenten unter der Führung von Colonel Dovchenko und Irina Spalko entführt, die verlangen, dass er auf dem Militärgelände Area 51 nach einer Kiste sucht, die die Überreste eines nichtmenschlichen Wesens enthält. Indy versucht zu fliehen und die Russen daran zu hindern, die Kiste an sich zu nehmen, doch sein Kollege Mac entpuppt sich als Verräter. Auf der Flucht vor den Agenten, denen es gelingt, die Kiste mit dem Skelett an sich zu nehmen, kann Jones nur knapp dem Tod entkommen.
Da die US-Regierung Indiana Jones verdächtigt, ein Doppelagent zu sein, wird ihm seine Professur entzogen. Er beschließt, die Stadt zu verlassen, wird aber von einem jungen Mann namens Mutt Williams überredet, zu bleiben, da Professor Oxley, ein alter Freund von Jones, in Schwierigkeiten steckt. Mutt zeigt Indy einen verschlüsselten Brief von Oxley, der ihm von seiner Mutter Marion geschickt wurde, die mit Oxley verschwunden ist. In dem Brief wird ein Kristallschädel erwähnt, für den sich Indy und Oxley während ihrer Studienzeit interessiert haben. Indiana Jones und Mutt reisen nach Nazca, Peru, um den Hinweisen in dem Brief nachzugehen.