Chronologisch gesehen spielt die Serie während des dreijährigen Zeitraums zwischen den Prequel-Filmen Angriff der Klone und Die Rache der Sith. Die Serie schildert die Handlungen verschiedener Charaktere der Star-Wars-Prequel-Trilogie, darunter Anakin Skywalker, Obi-Wan Kenobi, Mace Windu und andere Ritter des Jedi-Ordens während des Konflikts, der die Klontruppen der Galaktischen Republik gegen die Kampfdroidenarmeen der Konföderation Unabhängiger Systeme und der Sith anführt.