Ein MSDF-U-Boot kollidiert mit einem US-Atom-U-Boot, wobei alle 76 Menschen an Bord getötet werden, darunter auch der Kommandant Shiro Kaieda. Die Besatzung überlebt jedoch. Der Unfall ist eine Täuschung, um die Besatzung des MSDF-U-Boots an Bord der Seabat zu bringen, einem Atom-U-Boot, das heimlich von der japanischen und der amerikanischen Regierung gebaut wurde. Doch Kaieda belädt die Seabat mit Atomraketen und meutert plötzlich und flieht.