„Der verlorene Sohn“ erzählt die Geschichte von Jared (Lucas Hedges), dem Sohn eines Baptistenpastors in einer kleinen amerikanischen Stadt. Im Alter von 19 Jahren erzählt er seinen Eltern (Nicole Kidman und Russell Crowe) von seiner Homosexualität. Jared steht vor einem Ultimatum: Teilnahme an einem Umwandlungstherapieprogramm - oder von seiner Familie, seinen Freunden und seinem Glauben dauerhaft verbannt und gemieden werden.